科莫多巨蜥的胃酸达到了每升1000毫克,而且它们一次能够吞下相当于自身体重两倍的食物。这些食物会被它们存放在胃里面,以便进行消化和吸收。在科莫多巨蜥的肠道中,有着与其他动物不同的细菌群落。肠道中还包含着其他种类的微生物。这些微生物通过分解蛋白质来帮助对抗饥饿感。此外,科莫多巨蜥的肝脏也具备着极强的代谢功能。科莫多巨蜥可以吃掉相当于自己体重20%的食物。科莫多巨蜥的肝脏是世界上最大的器官之一,并且它们的胆汁是所有脊椎动物中最为丰富的。